到目前为止，微生物肥料在国外农业生产上的应用研究已有100多年的历史，但在烟草上的应用研究相对较少，我国自20世纪80年代末90年代初开始进行了叶面肥料、缓释控释肥料、微生物肥料、有机无机生物复混肥以及有机废弃物产业化的研究，解磷、钾细菌肥料开始应用于烟草。
1、微生物肥料在烟草生产中的效应
1.1 改良植烟土壤，改善农业生态环境
化肥的大量使用容易造成土壤结构破坏、板结，降低肥料利用率和肥效，对烟叶质量和安全性产生不良影响。烟田使用微生物肥料，利用固氮、解磷、解钾菌的生命活动,可以培肥地力，增加土壤有效养分，提高烟田肥效，充分利用土壤资源，有利于烟草生产的可持续发展。有效微生物群(EM)可加速土壤有机物分解转化，提高土壤速效养分含量，明显改善土壤性能。
1.2提高烟叶的产量与品质
很多研究指出，微生物肥料应用于烟草上可提高烟叶的产量、品质，增加上中等烟比例，进而提高经济效益。夏振远等研究表明，微生物肥料对烤烟的产量和质量都有显著的提高，其中施用生物钾肥后产量、产值和均价分别比对照高28.51%、33.38%和3.78%。几种微生物肥料的施用对土壤主要肥力要素含量有所提高。何金旺报道了生物钾肥对烤烟产量和品质的影响，试验结果表明施用生物钾肥对提高烤烟的产量和品质有明显的作用。谢永萍等研究表明，试验用的几种微生物肥料对烤烟生产均具有一定增效作用,定型后的烟草专用微生物肥料效果更佳，与对照比较，可提高产量5.7%～23.3%。上中等烟率增加2.1～6.1%，同时对烟叶内在质量有一定提高，化学成分间协调性变好，香味、杂气和刺激性有所改善。
1.3 提高烟草抗病害能力
微生物肥料不仅可以提高土壤母质解磷、解钾性能，向烟草提供更多的磷素、钾素营养，增强烟株的抗病能力，而且可通过对土壤微生物区系的调控来预防控制烟草土传病害。据董艳等研究报道，微生物肥料能不同程度减轻烟草野火病、炭疽病和赤星病的发病率和病情指数，其中以施用保得土壤接种剂和叶面增效剂的处理对病情发展有较好抑制作用。郭富伟等的研究表明，施用生物磷钾肥后，烤烟赤星病、野火病、角斑病、普通花叶病、马铃薯Y病毒病等发病率、病情指数均较对照低。
